四姑娘山地质公园地区属于全球36个生物多样性热点区域之一(中国西南山地),独特的极高山生态系统孕育了丰富的生物多样性,是中国重要的生态屏障及动植物走廊带,也是具有国际意义的陆地生物多样性的关键地区。        据初步调查和资料统计表明,四姑娘山地质公园内维管束植物共有123科536属2343种,珍稀特有种类多,其中列为国家重点保护野生植物有独叶草、红花绿绒蒿等9种。大型真菌约有103种,其中国家重点保护菌类2种,均为国家二级重点保护。        四姑娘山地质公园共有野生动物343种,其中国家一级保护野生动物有23种,二级保护野生动物55种。国家重点保护野生动物中有鸟类43种,兽类32种,两栖动物3种。
       四姑娘山地区拥有我国成片分布数量最多、面积最大、树龄最古老的中国沙棘乔木天然林,其中双桥沟内隆珠措现存有目前已调查到的最古老的中国沙棘,树龄超750岁。数以千计的沙棘树或盘曲,或异伸,既有虬髯老松的苍劲,又含园林盆景的秀美,而又不失其挺拔雄壮。
       形状奇特的沙棘树林是木尔寨沟内一道独特的风景线。沟内沙棘树特别多,树干长势奇特,枝繁叶茂,与长坪沟的枯树滩极为相似。
       虹桥沟,沟长约为30km,成片的原始沙棘林生长于海拔3000米以上的高山峡谷中,树木枝干虬曲苍劲,树龄多逾百年,与雪山、溪流和草甸相映成趣。
       海拔3840m,是双桥沟的最后一个景点。这片红杉林绵延2km,面积50余公顷,与紫果云杉、冷杉等常绿针叶物种和杜鹃、忍冬以及沙棘等高山灌木丛,形成了完整而独特的四川红杉林植被群落。
       成片的云杉林生长在海拔2800~4000m的山谷中,树木平均高约30m,笔直挺拔如绿色巨塔,与冷杉、杜鹃等植物构成层次分明的垂直生态,是川西高原保存完好的原始暗针叶林代表。
       位于四川宝兴县与小金县交界处,是横断山脉北段罕见的四川红杉原始群落。上千株红杉树分布于海拔2500~3500m的山坡,树干笔直如剑。深秋时节,漫山层林尽染,被誉为“川西高原的火焰长廊”,既是自然科考的重要样本,也是徒步摄影者追逐光影的天堂。